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故事從1582年的劇本情節(jié)展開。

1582年，地點是安土城。

在父親森可成去世后，森家兄弟們受到了信長的特別恩寵，能夠在他身邊侍奉。蘭丸作為武士之子，一直渴望在戰(zhàn)場上為織田家效力，但信長認為時機尚早。盡管蘭丸被賜名為成利，他仍未被允許舉行成人禮。蘭丸心中暗自決定，不再沉迷于大人的寵愛，而是要通過戰(zhàn)功來侍奉信長，他的機會正悄然臨近……

回到家中，收到了信長召見的命令。來到評定間，見信長怒氣沖沖地指揮整備武具和糧草，準備進攻伊賀。盡管伊賀與織田方的德川家有同盟關系，但信長全然不顧?？椞锎筌娧杆俪霭l(fā)攻打伊賀。到達后，藤堂高虎等謀士正在考慮如何應對閉門不出的伊賀眾，信長卻驚人地表示：“我不是來與他們作戰(zhàn)，而是要摧毀他們的根據地。”眾人驚訝之際，信長下令：“在附近的村莊放火！神社、佛閣全燒毀！無論田地還是山林都放火吧！”顯然是要讓伊賀全境化為廢墟！天正12年1月，信長下令全面剿滅伊賀地區(qū)，村莊、山林、寺廟無一幸免。不論是和尚、忍者還是婦女，均遭殺害。這場事件被史稱為『天正伊賀之亂』。信長為何如此殘暴，至今仍不得而知，但伊賀確實遭受了重創(chuàng)。伊賀眾的首領百地三太夫生死未卜，伊賀忍者團體遭到毀滅性打擊，信長的暴行也更加顯著了…事后，伊賀的糧食和防御力大幅下降。

回到安土城，沒有多言，蘭丸在家靜養(yǎng)一個月。出門時得知駿府城主穴山梅雪投降德川家康，這是否預示著武田氏即將消亡？蘭丸繼續(xù)修養(yǎng)，直到評定會。來到評定間，信長慷慨激昂地宣布要消滅武田家，并讓信忠擔任總大將，自己作為后援，浩浩蕩蕩開赴甲府城！武田勝賴意識到死守不利，帶軍前往巖殿城，卻未料到此舉斷了自己的退路。到達巖殿城時，德川家康的部隊已展開攻勢，迫使勝賴對織田信忠的軍隊發(fā)起最后一擊…這一戰(zhàn)22000對8000，只要信忠不死，即可擊潰武田勝賴。全殲武田軍后，長期威脅織田家的武田家被消滅，武田勝賴自殺，年僅37歲…嫁給勝賴的北條家公主也殉情，年僅19歲，其辭世詩云：“一如黑發(fā)紛亂之世絕無盡，于思念消逝的露水之玉”。此后，曾屬武田家的真田昌幸獨立，在上田城建立了真田家。

天目山之戰(zhàn)消滅武田后，織田軍在信長的提議下，于富士山下舉辦慶功宴。宴席上，日向守明智光秀感慨道：“打倒如此強盛的武田家，我們的力量可謂天下第一。擁戴如此卓越的主君，我們充滿斗志，今后要朝統(tǒng)一全國的目標前進！”話音未落，信長勃然大怒，斥責光秀無端攬功，信忠上前勸阻，信長卻在他面前打了光秀幾個耳光。盡管信長事后向光秀道歉，但一層陰影已籠罩在即將統(tǒng)一全國的織田家上空…

回到安土，聽聞信長召見，森蘭丸再次來到評定間，得知羽柴秀吉請求援助。信長認為猴子這么做是為了讓自己獲得功勞，于是決定讓信忠擔任總大將，帶少數兵力前往，而蘭丸作為信長的親隨，自然隨行。信長決定先到京都與信忠會合，稍作休整后再出發(fā)。在京町與信忠相遇，信忠表達了對僅帶少量兵力的不安，但信長確信沒有人能對自己造成威脅，于是讓信忠去妙覺寺休息，自己和蘭丸則留在一個至今仍為人津津樂道的地方——本能寺。

當晚，攜帶眾多珍貴茶具的博多豪商島井宗室，與聞名畿內的茶圣千宗易以及信長的朝廷聯(lián)絡官菊亭晴季，應信長之邀齊聚本能寺舉行茶會。茶會平靜地結束了，大家進入夢鄉(xiāng)。然而，破曉時分，京都的孩童被軍隊的馬蹄聲驚醒，回響在清晨的街道中…信長被驚醒，才知本能寺已被大軍包圍，而蘭丸認出了大將的旗幟——水色桔梗，明智光秀！信長知道大勢已去，命令小姓們焚燒本能寺，但蘭丸決心保護信長，舉槍殺向明智軍…第一戰(zhàn)1對4，這場個人戰(zhàn)全靠你自己。

經過森蘭丸的浴血奮戰(zhàn)，終于殺出一條血路，帶著信長沖出被烈火吞噬的本能寺。但在逃亡過程中，蘭丸不幸被流箭所傷，拖著傷體，他和信長來到信忠駐地妙覺寺，卻發(fā)現此地也被光秀的士兵包圍，信忠生死不明。蘭丸建議從鳥羽向南繞路回安土，途中又遇明智的追兵…第二戰(zhàn)2對5，但蘭丸受傷，而信長不能倒下，難度比第一戰(zhàn)高許多，仍需靠自己。

艱難取勝后，森蘭丸體力降至20，兩人繞路南返安土，途經大和郡山城，決定回安土后立即出兵討伐逆賊明智光秀。由于大和郡山城的筒井順慶與明智關系密切，兩人馬不停蹄趕到從屬于織田家的甲賀之里，從甲賀之里首領多羅尾光俊處得知信忠已壯烈戰(zhàn)死，而光秀正與畿內諸大名和朝廷聯(lián)絡。準備回安土的蘭丸因傷口化膿發(fā)起高燒，多羅尾光俊用獨門密藥治愈了蘭丸。經過一番道謝和奔波，兩人終于回到安土，準備點兵討伐明智光秀，卻得知在逃亡過程中，羽柴秀吉已迅速返回畿內，在天王山擊潰了明智光秀，光秀死于不知名農民之手。信長一面贊揚猴子的神速，一面對在此次事變中立下大功的森蘭丸給予高度贊賞，并準許蘭丸元服，正式成為織田家武將。元服名并非先前的“成利”，而是從信長名字中取一字，命名為“長定”。森長定也決心如兄長森長可般，為織田家效忠到底。

就這樣，在織田家內部引發(fā)巨大動蕩的『本能寺之變』終于結束了。