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游戲一開始，NEO身處一個虛擬空間中，這里會不斷冒出敵人。實際上，這只是讓玩家熟悉操作的步驟，等到你被擊敗后，游戲才會正式開始。（注意：此時電腦會根據(jù)玩家的表現(xiàn)來評估適合的游戲難度）

第一關(guān)

就像電影情節(jié)一樣，第一關(guān)描述的是特工抓捕NEO的故事。本關(guān)類似于MGS的潛入類型關(guān)卡，不需要擊殺敵人。根據(jù)游戲中提供的提示（畫面上會有閃光的地方）前進(jìn)，進(jìn)入一個辦公室，打開窗戶來到室外，乘坐升降機上樓。當(dāng)升降機停下后走出來，會觸發(fā)一段小劇情，之后出現(xiàn)一名警察，將他推下樓，然后沿著墻邊繼續(xù)走，小心不要掉下去，再次乘坐升降機到樓頂，會出現(xiàn)很多警察，把他們推倒，然后迅速進(jìn)入門內(nèi)。這里要注意，一旦被警察抓住，立即按鍵掙脫，動作慢了就會游戲結(jié)束。進(jìn)入門后沿著樓梯一直向下走，來到一個房間，這里有3個警察，小心不要被抓，從房間右側(cè)的緊急出口向下跑，來到NEO的辦公室，繼續(xù)跟隨提示跑到終點，本關(guān)結(jié)束。

PS。本關(guān)設(shè)計相對人性化，對于不擅長潛入類型的玩家，被抓住一次后可以直接跳過此關(guān)。

第二關(guān)

從這一關(guān)開始的幾關(guān)都講述了NEO如何學(xué)習(xí)武功。雖然在電影中，NEO只是翻了幾下白眼就說（I KNOW GONGFU），但游戲制作團(tuán)隊將NEO學(xué)習(xí)功夫的過程以關(guān)卡的形式詳細(xì)呈現(xiàn)給大家。本關(guān)開始時，NEO華麗登場，打扮成了DOA中的"李劍"，并且打斗動作也相似。根據(jù)游戲的教學(xué)提示一路擊敗敵人，中間沒有分支，直到BOSS戰(zhàn)。

BOSS戰(zhàn)：很簡單，繞到后面，發(fā)動FORCE，用三招就能解決，但要注意不要被抓到。解決后，本關(guān)結(jié)束。

PS：從這一關(guān)開始，每關(guān)開始前都可以選擇FORCE，選擇時可以按X鍵查看這個FORCE的功能和發(fā)動方法，并有動畫展示。

第三關(guān)

本關(guān)教授玩家如何使用格斗武器，一開始玩家就手持一把日本刀，并且會得到新的FORCE。根據(jù)教學(xué)提示將本關(guān)的敵人全部消滅即可。

第4關(guān)

一開始就進(jìn)入BOSS戰(zhàn)，對手是個日本武士，刀法高超。要多運用剛學(xué)到的FORCE技能，過一會兒催尼締會前來助戰(zhàn)。BOSS會使用影分身術(shù)，但分身不強，兩人合作可以輕松應(yīng)對。接下來進(jìn)入關(guān)卡的下半部分，最初是在一個庭院中，快速擊敗幾個敵人后進(jìn)入房間，房內(nèi)有BOSS，但暫時無法擊敗他。跟隨他前行，他會設(shè)置火墻，利用FORCE并按X鍵可以跳過。一路上會有小兵騷擾，全部消滅后，進(jìn)入最里面的房間進(jìn)行BOSS戰(zhàn)。這個BOSS是個BC，沒有固定的打法，隨意對付他即可。

第5關(guān)

這一關(guān)非常搞笑，場景設(shè)在一個中國的小酒館內(nèi)，任務(wù)是在限定時間內(nèi)獲得盡可能高的分?jǐn)?shù)。接著EG開始，從門外沖入一群斧頭幫的成員（外貌與某電影中的相似），并喊著"我要宰了你"（絕對是中文發(fā)音），拿起旁邊的斧頭與他們對戰(zhàn)，堅持到時間結(jié)束即可過關(guān)。需要注意的是，后面會出現(xiàn)投擲飛斧的敵人，需要小心應(yīng)對。

第6關(guān)

本關(guān)同樣是教學(xué)關(guān)，但只能使用射擊武器，場景仍然在中國。一開始就會出現(xiàn)BOSS，但暫時無法擊敗。跟隨他在整棟樓內(nèi)多次追逐，最終到達(dá)頂樓才能擊敗他。本關(guān)的敵人也全部持槍，火力很強，要多使用FORCE來躲避子彈。在打BOSS前，先清理掉周圍的小兵，如果你的HP剩余一半以上，就可以和BOSS硬拼了。

第7關(guān)

終于來到電影中最精彩的劇情之一，摩非斯對戰(zhàn)NEO。摩非斯攻擊力強，被他連續(xù)攻擊可不是鬧著玩的。使用戰(zhàn)術(shù)可以快速解決他。擊敗他一次后，他會恢復(fù)滿血，再次與你交手，并給你新的FORCE。再次打敗他后，進(jìn)入下半部分，你必須比他先到達(dá)電話所在的位置。路上需要跳過幾個坑，還要攀爬。使用FORCE加跳躍可以輕松通過。難點在最后一面墻，因為墻很高，雙段FORCE也無法到達(dá)，必須先貼著右邊或左邊跑，跳到正面墻上，然后再跳到旁邊的墻上，如此反復(fù)三次即可。

第8關(guān)

到了這一關(guān)，游戲才真正開始。摩非斯帶NEO去見先知，返回的路上被圍捕。最初NEO就與大家分開了，得到新的FORCE可以打破帶裂縫的墻壁。本關(guān)就像迷宮一樣，大家要多注意墻壁，看到裂縫就打破才能開辟新路徑。路上的敵人全是持槍警察，想怎么打隨玩家選擇，個人推薦近戰(zhàn)。

在頂樓的劇情中，摩非斯為了讓大家撤退，面對特工，NEO帶領(lǐng)眾人逃跑。途中遇到的警察全被打倒后，會發(fā)現(xiàn)C4炸彈，根據(jù)催尼締的提示放置并引爆。當(dāng)來到第二根柱子時，NEO剛剛放好炸彈，卻被迫與隊友分開，此時千萬不要引爆炸彈，否則會有危險。在隊友說完話后，劇情繼續(xù)發(fā)展，出現(xiàn)一個無法擊敗的特工，他即使被打下臺也不會死。盡量與他周旋一段時間，之后隊友會炸開墻壁，立即用FORCE跳過去，繼續(xù)劇情，順路前進(jìn)，消滅沿途敵人，到達(dá)出口，本關(guān)結(jié)束。

第9關(guān)

這是經(jīng)典劇情之一，尼歐和催尼締前去救摩非斯。最初在大堂內(nèi)會出現(xiàn)成群的敵人，不過他們都很容易對付，各位可以自由地展示技巧。一共會有三批敵人增援，第三批中有四個小BOSS，但都不難應(yīng)付。消滅所有敵人后，進(jìn)入下半部分，在樓頂戰(zhàn)斗。特工會多次出現(xiàn)，普通攻擊對他無效，必須把他推到高壓電上或打下樓才能擊敗。同時，敵人會不斷增援，加上時間限制，使這一關(guān)變得非常具有挑戰(zhàn)性。在消滅一定數(shù)量的敵人后，劇情會觸發(fā)，出現(xiàn)30秒倒計時，這時需要無視周圍的敵人，直接奔向直升機方向，在大樓邊緣時立刻發(fā)動FORCE二段跳，跳上飛機。

接下來是最難的部分，在飛機上用機槍消滅屋頂?shù)臄橙恕４蛄艘粫汉?，敵人的飛機會出現(xiàn)，此時摩非斯的HP開始警報。要注意，會有特工出現(xiàn)，必須用FORCE射擊來打敗特工，千萬不能掃射，否則會誤傷摩非斯。在摩非斯逃跑時，旁邊還會有一個特工出現(xiàn)，大家要注意。擊落敵機并消滅樓房內(nèi)的敵人后，救出摩非斯，劇情繼續(xù)。然后是NEO與SMITH的對決，注意他是無法被徹底打敗的，會不斷恢復(fù)HP，必須像原作那樣把他推到地鐵軌道上讓地鐵碾過。之后便是逃跑，沿路一直向下走，到達(dá)指定地點本關(guān)結(jié)束。

第10關(guān)

本關(guān)開始于一個奇怪的地鐵站，向前走會發(fā)現(xiàn)地鐵到來，但需要車票。返回樓梯處，會看到空中漂浮著許多閃光物，按L2可以拿到車票。上車后一直向后走，到第三節(jié)車廂時要小心不要掉下去，進(jìn)入第四節(jié)車廂看到電話，此時需要使用FORCE才能過去。通過電話得知要找到正確的門才能離開。回到第二節(jié)車廂，在墻上有一個開關(guān)，按下去可以停車。這時需要反復(fù)進(jìn)入車廂以確保車廂處于正位，然后在聽到列車員說話時立刻按下開關(guān)，找到正確的門。出來后是另一個地鐵站，SIMITH和大量雜兵出現(xiàn)，此時不要戀戰(zhàn)，看到火車過來馬上跳上去逃跑，因為雜兵是打不完的。下火車后上樓梯，再次展開逃亡，不需要戰(zhàn)斗，沿路跑就行，只有一條路，所以不會迷路。跑到303房間后觸發(fā)劇情，NEO力量覺醒，開始對付三個特工，結(jié)束后本關(guān)完成。

第11關(guān)

本關(guān)開始可以選擇關(guān)卡，地圖總共有五塊，首先到最下面左側(cè)的這塊地圖，任務(wù)是保護(hù)一個老人。從他家出來后會有大量敵人出現(xiàn)，不過我方也有支援，快到火車站時會出現(xiàn)一個特工，但現(xiàn)在特工對我們來說已經(jīng)不構(gòu)成威脅，可以盡情對付他。把老人送上火車后，本關(guān)結(jié)束。

第12關(guān)

到達(dá)下面右側(cè)的地圖，本關(guān)與上一關(guān)相似，也是保護(hù)任務(wù)，不過這次要保護(hù)的是一名女性。沒有太多需要說明的，清理路上的敵人，到達(dá)目的地即可過關(guān)。

第13關(guān)

這一關(guān)同樣是保護(hù)任務(wù)，但難度較高，因為需要保護(hù)的人經(jīng)常暴露在外，生命值下降很快，大家務(wù)必要速戰(zhàn)速決。

第14關(guān)

這關(guān)與其說是保護(hù)，不如說是并肩作戰(zhàn)。清理完門口的雜兵后，劇情開始，你會看到一個特工被打飛。進(jìn)屋后發(fā)現(xiàn)是一個中國人干的（中國功夫果然厲害?。Ｈ缓竽阈枰退蛞粓?，不過很容易獲勝。戰(zhàn)斗結(jié)束后繼續(xù)劇情，緊接著與他合作清理雜兵和特工，順利過關(guān)。

第15關(guān)

這是保護(hù)任務(wù)中最艱難的一關(guān)。剛開始需要追趕警察，快到達(dá)頂樓時會出現(xiàn)30秒倒計時，必須在規(guī)定時間內(nèi)到達(dá)頂樓。到頂樓后，需要與一個特工展開激烈戰(zhàn)斗，打贏后即可過關(guān)。

第16關(guān)

為了節(jié)省篇幅，四個救援任務(wù)我會一起描述。首先是救一個長者（地圖左下角），他被敵人包圍，需要你想辦法堵住敵人增援的入口。首先清理周圍敵人，否則長者很快會被擊倒。然后跳到敵人進(jìn)入的門上方，破壞支架堵住門。接著乘電梯到起重機控制臺，把長者送到右邊的平臺。此時敵人增援出現(xiàn)，還有一個攜帶火箭炮的敵人。堅持一段時間后觸發(fā)劇情，然后回到起重機控制臺，把火箭炮敵人的房間壓垮。消滅敵人后過關(guān)，接著到地圖右下角救老摩和催尼締，過程中快速清理敵人。最后一個特工駕駛飛機攻擊，迅速拿起地上的火箭炮擊落飛機過關(guān)。

到地圖右上角，消滅路上的雜兵后繼續(xù)前進(jìn)，找到需要救助的黑人，幫助他擊退敵人后繼續(xù)前行，清理一群敵人后，會有三個特工出現(xiàn)。特工不難對付，好好應(yīng)對他們吧。

最后到達(dá)地圖左上角救奈奧比，最初只有幾個雜兵，很容易對付，隨后三個特工出現(xiàn)，擊敗他們后，他們會再次出現(xiàn)。將這里的敵人與特工全部擊敗后過關(guān)，注意敵人會多次增援。

第17關(guān)

這關(guān)與塞拉夫的戰(zhàn)斗非常有趣。首先在房間里進(jìn)行對戰(zhàn)，擊敗他一次后，會進(jìn)入傳統(tǒng)的中國武術(shù)"梅花樁"對決。需要注意的是，只有將他打下去才能削減他的生命值。接著，在電影院再次擊敗他，然后劇情推進(jìn)過關(guān)。電影院的戰(zhàn)斗部分相當(dāng)有趣。

第18關(guān)

經(jīng)典之戰(zhàn)：NEO對抗多個史密斯。沒什么特別技巧，只需盡情施展實力，堅持一段時間即可通關(guān)。

第19關(guān)

進(jìn)入第一道門，這關(guān)設(shè)計得相當(dāng)復(fù)雜。我代表廣大玩家對制作者表示無奈，這關(guān)完全是在浪費時間。需要在四個空間中尋找正確的門。第一個空間的正確門在中間偏左的位置，第二個空間的門在進(jìn)入后的位置后面。第三個空間的門需要等待一個女人幫忙打開。第四個空間的門在一個高臺上。從第二個空間開始，會有紅色螞蟻干擾，只能用火焰攻擊它們，而且似乎會不斷出現(xiàn)，所以還是建議快跑。給大家一個小提示，按方向鍵上找門會更容易。

第二道門并不難，只是敵人比較強，多使用武器就能通過。最后有一個BOSS戰(zhàn)，這個BOSS會瞬移，但并不算很強。

第三道門，進(jìn)去就直接面對BOSS戰(zhàn)，BOSS本身不強，關(guān)鍵是要保護(hù)一個女人，不能讓她出事。打了一會兒，這個女人會來幫忙，擊敗BOSS后即可過關(guān)。

第20關(guān)

任務(wù)是保護(hù)攜帶鑰匙的人，沿途會遇到史密斯的復(fù)制人，務(wù)必好好照顧MR KEY，走到終點后進(jìn)入下半部分。在教堂中，出現(xiàn)大量復(fù)制人來襲，需要撐到MR KEY通知你才能離開。接著進(jìn)入一個會議大廳，與對手對抗，直到能夠離開，通關(guān)后本關(guān)結(jié)束。

第二十一關(guān)

隨后，我們進(jìn)入電影中的最終對決，NEO與史密斯展開了單打獨斗。這一戰(zhàn)并不難，NEO輕而易舉地應(yīng)對。之后，史密斯會變身成類似"變形金剛"的樣子。盡管他是最后的BOSS，但實際上非常弱，只需一直向左飛行，看到屏幕提示按X鍵時按下X，多重復(fù)幾次就能打敗他，接著就迎來了結(jié)局。